Die Untersuchung der Lungengesundheit am Schlachthof kann erste Hinweise auf eine Atemwegsproblematik im Bestand geben. Diese einfache und kostengünstige Methode liefert aufschlussreiche Informationen über die Häufigkeit mit der die Erkrankung auftritt, und den Schweregrad der Lungenschädigung. Da jedoch ähnliche Veränderungen z. B. auch durch andere Infektionen hervorgerufen werden können, ist diese Untersuchung alleine nicht als Nachweis für eine M. hyo-Infektion geeignet.